L'orthologie et la paralogie sont des concepts centraux en biologie ?volutive. La pr?diction des orthologues (g?nes homologues qui ont diverg? en raison de la sp?ciation) et des paralogues (g?nes homologues qui ont diverg? en raison de la duplication) fait partie int?grante de nombreuses m?thodes de g?nomique comparative. Un certain nombre de m?thodes sont utilis?es pour d?duire l'orthologie et la paralogie. Les orthologues et les paralogues peuvent ?tre d?duits ? l'aide de m?thodes bas?es sur les graphes et de m?thodes bas?es sur la phylog?n?tique. Cependant, les m?thodes bas?es sur les analyses phylog?n?tiques sont tr?s proches de la d?finition originale de l'orthologie et de la paralogie et sont connues pour ?tre pr?cises. Dans le pr?sent travail, un pipeline pour la d?tection des orthologues et des paralogues est d?velopp? sur la base de l'approche phylog?n?tique. Un ensemble de prot?ines a ?t? t?l?charg? ? partir d'UniProt et une base de donn?es a ?t? d?velopp?e. Des orthologues et des paralogues ont ?t? d?tect?s pour la s?quence de la prot?ine interrog?e. L'algorithme de chevauchement des esp?ces et le seuil de distance patristique par paire ont ?t? utilis?s pour identifier une pr?diction pr?cise et ajust?e des paralogues et des orthologues. Une interface conviviale a ?t? d?velopp?e pour faciliter l'utilisation.
| Author: Manpreet Singh Malhi |
| Publisher: Editions Notre Savoir |
| Publication Date: Dec 31, 2024 |
| Number of Pages: 60 pages |
| Binding: Paperback or Softback |
| ISBN-10: 6208405785 |
| ISBN-13: 9786208405786 |
