Entwicklung einer auf OpenGL basierenden grafischen Oberfläche für das de novo Design von Proteinstrukturen

Inhaltsangabe: Einleitung: Proteine sorgen daf?r, dass chemische Reaktionen in Zellen katalysiert und reguliert werden (Enzyme), sie ?bermitteln Signale von Zelle zu Zelle (Hormone), erkennen Signale und leiten sie dem Zellinneren zu (Rezeptoren), transportieren schlecht wasserl?sliche Stoffe wie Sauerstoff (H?moglobin) oder Eisen (Transferrin) und leiten oder pumpen Ionen durch Zellmembranen (Ionenkan?le und -pumpen). Proteine verleihen der Zelle ihre jeweilige Gestalt. Ihre dreidimensionale Struktur oder Terti?rstruktur enth?lt die wesentlichen Informationen, um all diese Funktionen effizient und unter strenger Kontrolle ablaufen zu lassen. Die r?umliche Struktur, also die Form, ist das Geheimnis der Funktionen von Proteinen. Ein wichtiges Thema in der Biologie der letzten Jahre ist deshalb die Bestimmung oder die Vorhersage solcher Proteinstrukturen. Der Schl?ssel zum Verst?ndnis der Funktionen von Proteinen hei t: Die Funktion ist von der dreidimensionalen Struktur abh?ngig, die wiederum durch die Aminos?uresequenz in einer definierten physikochemischen Umgebung festgelegt ist. Die experimentelle Bestimmung von Proteinstrukturen ist sehr aufwendig. F?r die Untersuchung der Struktur von Proteinen gibt es zwei Verfahren: Die R?ntgenstrukturanalyse und die Kernmagnetresonanz-Spektroskopie (Nuclear Magnetic Resonance, NMR). Bei Proteinen, die sich kristallisieren lassen, kann man mit der R?ntgenstrukturanalyse (Beugung von R?ntgenstrahlen) recht genau die Position jedes einzelnen Atoms in Bezug auf die anderen Atome des Molek?ls bestimmen. Die NMR-Spektroskopie erg?nzt die R?ntgenstrukturanalyse, da sie Informationen ?ber die dreidimensionale Struktur in L?sung liefert, etwa ?ber die Flexibilit?t von Teilen des Proteins, die sich in kristalliner Form nicht zeigen. Theoretische Aussagen, wie man von der Sequenz auf die Struktur schlie en kann, sind nach dem heutigen Stand der Technik noch sehr unzuverl?ssig. So liegen zwar h?ufig die Sequenzen f?r Proteine vor, abe

Author: Stephan Klokow

Publisher: Diplom.de

Publication Date: Aug 31, 2006

Number of Pages: 112 pages

Binding: Paperback or Softback

ISBN-10: 3838697952

ISBN-13: 9783838697956